Жалобу надо было до того нести, тк теперь начальник скажет "Документы направлены в суд, теперь судья будет решать, я ничего сделать не могу".
На суд пойдешь? Если первое лишение, то сходи - наверняка отделаешься штрафом. Готовься к тому, что суд могут отложить, перенести, так что можешь со временкой ездить достаточно долго.
Жалобу начальнику надо было бы все-таки зарегистрировать, но даже так приобщи ее к делу. И готовь ходатайство о прекращении дела по причине (перечисляешь все, на что жаловался). Перед процессом вручишь судье (правда времени ознакомиться у нее скорее всего не будет, но лишняя бумажка не повредит).
Еще совет - съезди сфотографируй место "происшествия", если реально можно щелкнуть так, чтобы твоя теория подтвердилась. Фотографию попросишь приобщить к делу.
Можешь за несколько дней до даты съездить в суд и в канцелярии попросить ознакомиться с делом- посмотришь, какие документы приобщены к делу, что в них написано, нет ли там ошибок.